测序送样要求
CE 测序
Sanger测序
样本类型 | 基本要求 | 其他要求 | 保存/运输条件 | 预处理说明 |
PCR产物 (已纯化/未纯化) |
样本量: >=30 μl(未纯化) >=10 μl(已纯化) 浓度: >=100 ng/μl(未纯化) >=20 ng/μl(已纯化) 纯度: OD260/2801.8~2.0 |
片段长度>=200 bp(如长度<200 bp,建议克隆后再测序) 送样前建议取3 μl样品电泳,能清晰检出单一明亮目的条带 建议自带测序引物 | 4°C 冷藏运输 | 超过30分钟需进行细胞冻存,冻存方法:细胞数目≥10万进行冻存(冻存液配制:90% FBS+10% DMSO)冻存液重悬混匀,放入冻存管中,梯度降温盒保存,使用足量干冰运输 |
质粒 | 样本量:>=20 μl 浓度:>=100 ng/μl 纯度: OD260/280 1.8~2.0 |
有条件情况下建议提供200 μl含有相应质粒的菌液备用 需注明载体全称、插入目的片段长度、测序要求 | 液体质粒:4°C 冷藏运输 干粉质粒:常温运输 | |
菌样(菌液/ 平板菌落) |
样本量: >=200 μl(菌液) |
建议为过夜培养(12 h)的新鲜菌液 尽量为高拷贝质粒,如为低拷贝质粒,建议直接提供质粒 需注明培养基、载体名称、是否需要诱导及抗性类型(除氨苄和卡那抗性,其余需自备) |
4°C 冷藏运输 | 菌液请放入EP管中,用封口膜封口,避免交叉污染 平板菌落请圈选标记,加缓冲垫以防运输中破损 |
送样附带引物的要求
引物总量>=10 μl,浓度>=10 pmol/μl;随机引物(RAPD引物)、简并引物、长度<15 mer或>30 mer引物、有特殊标记的引物或不纯的引物均不能用于测序;
尽可能提供引物全序列、PCR退火温度等信息。
备注:生工生物提供200多种通用引物,详情请见 常用载体测序引物清单。
TA克隆测序
PCR产物
未纯化产物,样本量>=20 μl,浓度>=20 ng/μl;已纯化产物,样本量>=25 μl,浓度>=50 ng/μl;
纯度:OD260/280 1.8~2.0;送样前建议取3 μl样品电泳,能清晰检出单一明亮目的条带;
请在订单上备注PCR所用引物的序列,以便用于克隆结果的核对分析;请提供克隆片段的相关信息,包括名称、大小、样品是否带有“A”尾以及PCR产物类型;
4°C冷藏运输。
Cosmid/Fosmid/BAC末端测序
质粒
样品量>=20 μl,浓度>=100 ng/μl,总量>=1 μg,纯度 OD260/280 1.8~2.0;有条件情况下建议提供200 μl含有相应质粒的菌液备用;需注明载体全称、插入目的片段长度、测序要求;
液体质粒:4°C 冷藏运输,干粉质粒:常温运输;
菌样
样本量>=200 μl(菌液);建议为过夜培养(12 h)的新鲜菌液,尽量为高拷贝质粒,如为低拷贝质粒,建议直接提供质粒;需注明培养基、载体名称、是否需要诱导及抗性类型(除氨苄和卡那抗性,其余需自备);
4°冷藏运输;
菌液请放入EP管中,用封口膜封口,避免交叉污染;平板菌落请圈选标记,加缓冲垫以防运输中破损;
片段长度多态性CE检测
荧光标记的PCR产物/酶切的荧光标记DNA片段/荧光标记的DNA片段
未纯化产物,样本量>=20 μl,浓度>=20 ng/μl;已纯化产物,样本量>=25 μl,浓度>=50 ng/μl;纯度:OD260/280 1.8~2.0;
一定要是荧光标记的PCR产物样本,主要用Fam、Hex、Tamrad、Rox四种荧光标记;送样前建议取3 μl样品电泳,能清晰检出单一明亮目的条带;检测所使用的内参照为LIZ500,不需要额外提供,如自带请注明;
4°C冷藏运输
荧光标记的样本请务必避光,请使用棕色管或以锡箔纸完全包裹。
合规性一代测序服务
PCR产物、质粒、菌样
样本类型 | 基本要求 | 其他要求 | 保存/运输条件 | 预处理说明 |
PCR产物 (已纯化/未纯化) |
样本量: >=30 μl(未纯化) >=10 μl(已纯化) 浓度: >=100 ng/μl(未纯化) >=20 ng/μl(已纯化) 纯度: OD260/2801.8~2.0 |
片段长度>=200 bp(如长度<200 bp,建议克隆后再测序) 送样前建议取3 μl样品电泳,能清晰检出单一明亮目的条带 建议自带测序引物 | 4°C 冷藏运输 | |
质粒 | 样本量:>=20 μl 浓度:>=100 ng/μl 纯度: OD260/280 1.8~2.0 |
有条件情况下建议提供200 μl含有相应质粒的菌液备用 需注明载体全称、插入目的片段长度、测序要求 | 液体质粒:4°C 冷藏运输 干粉质粒:常温运输 | |
菌样(菌液/ 平板菌落) |
样本量: >=200 μl(菌液) |
建议为过夜培养(12 h)的新鲜菌液 尽量为高拷贝质粒,如为低拷贝质粒,建议直接提供质粒 需注明培养基、载体名称、是否需要诱导及抗性类型(除氨苄和卡那抗性,其余需自备) |
4°C 冷藏运输 | 菌液请放入EP管中,用封口膜封口,避免交叉污染 平板菌落请圈选标记,加缓冲垫以防运输中破损 |
gDNA、cDNA
样本量≥10 μl,浓度≥20 ng/μl;4°冷藏运输;
其他样本
请致电:021-5707 2069,或发送邮件 seq@health.sangon.com 咨询样本要求。复杂序列测序
ITR测序
ITR Sequencing
质粒
样本量>=20 μl(每增加一个反应增加5 μl),样本浓度>=200 ng/μl,纯度 OD260/280≥1.8且OD260/230≥1.8;测序引物要求:扩增及测序引物距ITR结构200 bp以内,最优范围在80-200 bp,如需委托生工生物设计合成测序引物,需提供质粒全序列;
液体质粒4°C冷藏运输,干粉质粒可常温运输。
Poly(A/T)测序、常规复杂序列测序
质粒
样本浓度>=150 ng/μl,体积>=20 μl,以Nanodrop仪器为准,OD260/280>=1.8;如有可能,同时提供200 μl含有相应质粒的菌液备用;
引物要求:距离Poly结构200 bp以内,最优为80-200 bp;需注明载体全称和插入目的片段长度及测序要求;
4°C冷藏运输。