高通量测序送样要求

微生物多样性测序

总DNA或者包装完好的原始样品（如土壤、粪便、 水体和口腔物），样品名称清晰，具体要求参看 《高通量测序样品要求》

样本类型	基本要求	保存/运输条件	预处理说明
DNA/PCR产物	样本量：>=200 ng 浓度：>=10 ng/μl（以Qubit 测量为准）	4°C冷藏运输
环境样本(水样)	样本量： >=500 ml（浑浊水样） >=2 L（澄清水样）	-80°C干冰运输	用0.45 μm或0.22 μm的滤膜富集菌体,建议送1~2张滤膜
环境样本(土壤、污泥等)	样本量：>=5 g	-80°C干冰运输	样品需去除高等动植物残渣,混匀后送样
排泄物样本(粪便)	样本量： >=2 g（小鼠样本至少2~3颗）	-80°C干冰运输	肠道内容物、粪便类的样品请 快速取样、迅速低温保存,避免长时间放置
发酵物样本(发酵液)	样本量：>=5 ml	-80°C干冰运输

如有对照与实验样品的区分，标明正常样品与实验样品，如有分组，详细描述分组分析信息，以及分组比较的分析需求信息。

转录组测序

具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的 《RNA类高通量测序样品要求》

样本类型	基本要求	保存/运输条件	预处理说明
组织	样本量： >=200 mg/样（动物） >=500 mg/样（植物）	-80°C 干冰运输	新鲜组织样品当场分成小块 (动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙 醇速冻,保存于-80°C 冰箱
微生物	样本量： >=100 mg/样（真菌） >=107数量级（细菌）	4°C冰袋运输 (有RNA保存液) -80°C干冰运输 (无RNA保存液)	对于可能致病的微生物,生工将拒收;细菌样本需注明革兰氏阳性菌(G+)还是革兰氏阴性菌(G-),没有RNA组织保存液的情况下,也可用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,埋于足量干冰寄送。
细胞	样本量：>=5x10 个细胞	-80°C 干冰运输	富集后TRIzol重悬,注意取样后立即用液氮或干冰乙醇速,强烈建议细胞样品先做细胞鉴定及支原体/衣原体污染之后,再送出来。
血液	样本量：>=2 ml	4°C 干冰运输	抗凝剂不可使用肝素钠,可用EDTA或ACD抗凝剂,取血后以冰袋保存,切记不能使血液冻结,从取血之时开始计算,须在48小时之内送达生工上海总部高通量测序部
RNA	浓度>=100 ng/μl,总量>=2 μg/(普通转录组、全转录组及小RNA测序) 浓度>=200 ng/μl,总量>=5 μg/(全长转录组)	-80°C 干冰运输	为2.0~2.2;总RNA 28S:18S>=1,RIN>=8(全长转录组RIN>=8.5)

需告知物种信息以及对照与实验样品（如有分组，详细描述分组分析信息）。

单细胞测序

样本类型	基本要求	其他要求	保存/运输条件	预处理说明
单细胞悬液	样本量： >=10万个细胞 浓度： 700-1200个细胞/ul	细胞的大小（<40 μm）、 活性（>80%）、 细胞间无黏连（成团率＜5%）、 细胞状态好,无Ca2+、 Mg2+和EDTA等逆转录抑制剂及非细胞的核酸分子	4°C冷藏运输(需30分钟内送达生工总部) 干冰运输(冻存细胞液)预约上门取样	超过30分钟需进行细胞冻存,冻存方法:细胞数目≥10万进行冻存(冻存液配制:90% FBS+10% DMSO)冻存液重悬混匀,放入冻存管中,梯度降温盒保存,使用足量干冰运输
新鲜组织	样本量： 4-5块(0.3×0.3 cm, 不超过0.5×0.5 cm)	建议使用组织保存液	4°C 冷藏避光运输	取样后48小时内到达生工生物实验室
穿刺样本	样本量：>=3 根	需粗针采集,建议使用组织保存液	4°C 冷藏运输	取样后48小时内到达生工生物实验室
新鲜全血	样本量：>=5 ml		4°C冷藏运输(需8小时内运输至生工总部） 干冰运输(冻存细胞液）	冻存样本需收集PBMC冻存后用足量干冰运输
细胞系	样本量： 1/3-1/2瓶底壁为宜	选取生长状态良好的细胞系以贴壁细胞为例,一般选择生长良好的细胞系	常温运输	去掉旧培养液,灌满新的培养液,使用不透气的盖子,将培养瓶盖用封口膜封紧,放些缓冲介质避免培养瓶大幅度晃动

细胞

样本需为真核生物，样本量推荐在1-100个细胞之间；细胞放入SMART-seq2试剂盒指定的裂解液中；-80°C干冰运输。

FF样本
真核物种新鲜组织样本；
FF样本
有物种限制，具体请联系页面下方的技术人员联系方式咨询。

样本类型	基本要求	其他要求	保存/运输条件	预处理说明
新鲜动物组织	样本量：>=0.4 g	供体需要幼嫩（例如:小鼠一般使用C57或者bal b/c 6-8周左右成年鼠最适宜,尽量不要周龄过大的小鼠）	4°C冷藏运输	放入组织保存液,并在48小时之内需要运输至生工总部
穿刺样本	样本量：>=3 根	需粗针采集
新鲜全血	样本量：>=3 ml	样品为未经任何处理的未离心全血,只可使用EDTA真空抗凝管(不可替换其他抗凝试剂),取样后轻轻放入管中颠倒混匀	4°C冷藏运输	EDTA抗凝的全血,并在8小时之内需要运输至生工总部
细胞系	样本量： 1/3-1/2瓶底壁为宜	选取生长状态良好的细胞系	新鲜培养细胞,常温运输； 冻存细胞液,干冰运输
单细胞悬液	样本量： >=10万个细胞	细胞的大小(<40 μm)、活性(>80%)、形态(大小均一)、浓度等均有要求,要求悬液背景干净、 细胞团及碎片杂质<5%,不能存在反转录抑制剂,即不含有Ca2+ 和Mg2+	冻存细胞液,干冰运输

单细胞免疫组库测序只适用于人或小鼠样本；
用于制备单细胞核悬液的样本无法进行单细胞免疫组库实验；
V(D)J 建库建议先进行 T/B 细胞流式分选或磁珠富集，未富集样本不会影响 5‘转录组数据，但 T/B 细胞占比过低会导致TCR/
BCR 文库建库失败。

基因组测序

父本=1，母本=1，分离子代野生型>=20个体，分离子突变型2>=20个体。

组织样品或者已经提取好的总DNA（浓度>=25 ng/μl，体积>=20 μl），样品名称清晰，具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的 《高通量测序样品要求》

只接收提取好的DNA，浓度>=5 ng/μl，体积>=20 μl； 需注明是单链DNA或者双链DNA。

表观遗传测序

取新鲜活细胞提取细胞核，并用转座酶预处理后的产物（生工提供试剂和操作指南）；
-20°C保存，干冰运输；
注意：细胞样本容易被支原体污染，在测序是除获取细胞基因组，还会测到支原体序列，为避免支原体占用测序数据量，请提前进行支原体检测并提供无支原体污染的细胞。

基因分型测序

人组织样品或者已经提取好的总DNA，样品名称清晰，具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的 《高通量测序样品要求》 。

需明确是疾病或者肿瘤样本，如果是疾病，建议提供家系样本（亲本和子代）；
如果是肿瘤样本，建议提供肿瘤组织和癌旁组织或者血液（非血液病）作为对照，如无法提供对照，可能会得到过多假阳性位点
导致后续筛选工作增加。

其他项目

双链DNA（已纯化），样本量>=20 μl，浓度>=10 ng/μl；
目标条带清晰，没有弥散和杂带污染；
4°C冷藏运输；
适配体上下游固定引物序列（5’-3’），适配体产物长度分布范围。

PCR产物（已纯化），浓度>=10 ng/μl，体积>20 μl，以Qubit检测结果为准；
4°C冷藏运输或干冰运输；
客户需提供参考序列并且标注清楚靶区域的位置信息。

PCR产物（已纯化），浓度>=10 ng/μl，体积>20 μl，以Qubit检测结果为准；
4°C冷藏运输或干冰运输；
需要客户提供扩增正反向引物序列、sgRNA前后固定序列以及sgRNA文库信息。

PCR产物（混合好的），浓度>=10 ng/μl，总量1~2 μg，以Qubit检测结果为准；
目的片段长度<500 bp；
如需拆分及分析，需提供引物、Barcode信息以及分析要求；
建议扩增引物5'加磷酸化修饰，否则部分序列可能无法连接上测序接头，导致无法被测序。

文库DNA，浓度>10 ng/μl，总量>500 ng；
文库长度范围在300~350 bp左右最佳，不能超过600 bp（含接头序列）；
需提供双端各8碱基的index序列，i7 index在前，i5 index在后，且不与本公司自建文库index组合重叠；
需提供文库来源，诸如是扩增子文库还是转录组文库。

KBSeq全质粒测序