毛细管电泳测序(Capillary Electrophoresis,CE)是建立在原有的高分辨率变性聚丙烯酰胺凝胶电泳序列分析法的基础上的一种测序方法。 主要是使用毛细管作为为分离通道、以可流动的聚合物为介质、用高压直流电场为驱动力的新型液相分离技术。生工测序部目前使用的ABI 测序仪使用的就是毛细管电泳的测序原理,正常情况下测序的有效测序长度不低于700 bp,一般可达850 bp。生工生物现拥有数十台测序仪,并配备专业的团队,可为您提供基本测序、克隆测序及Cosmid/Fosmid/BAC末端测序,可以满足您的测序需求。
2023年8月,生工生物与赛默飞正式签署战略合作伙伴协议并共建基因科学联合示范实验室。在DNA测序方面,生工生物也将得到从平台软硬件、配套试剂、 维护保养和技术开发等方面的来自官方的全程支持。
我们的优势
Sanger测序
Sanger Sequencing
Sanger 测序是由 Fred Sanger 及其同事发明的,相对于二代测序,现在也习惯性的称之为一代测序。就目前而言,Sanger测序由于操作简便,价格低廉,仍然得到广泛应用。生工生物在全国建有多个测序基地,可以实现就近安排测序,节省物流时间,最快当日即可收到测序报告。
项目名称 | 样本类型 | 技术/设备平台 | 交付周期(工作日) | 交付结果 |
Sanger测序 | PCR产物(已纯化/未纯化)、质粒、菌样 | 3730XL测序仪 | 1~3 | ab1 格式的峰型彩图 seq 格式的序列文件 |
如果测序引物不在免费提供的通用引物库之中,或无法自行提供测序引物,我们可提供配套的测序引物的设计合成服务,这通常会收取一定的引物合成费用。
项目名称 | 纯化方式 | 碱基范围 | 交付周期(工作日) | 合成量 |
测序引物的设计合成 | HAP纯化 | 11~59 mer | 1~2 | 3 OD |
样本类型 | 基本要求 | 其他要求 | 保存/运输条件 | 预处理说明 |
PCR产物(已纯化/未纯化) | >=30 µl(未纯化) >=10 µl(已纯化) >=100 ng/µl(未纯化) >=20 ng/µl(已纯化) | 4°C 冷藏运输 | ||
质粒 | 液体质粒:4°C 冷藏运输 干粉质粒:常温运输 | |||
菌样(菌液/平板菌落) | 4°C 冷藏运输 | 菌液请放入EP管中,用封口膜封口,避免交叉污染 平板菌落请圈选标记,加缓冲垫以防运输中破损 |
送样附带引物的要求
引物总量>=10 μl,浓度>=10 pmol/μl;
随机引物(RAPD引物)、简并引物、长度<15 mer或>30 mer引物、有特殊标记的引物或不纯的引物均不能用于测序;
尽可能提供引物全序列、PCR退火温度等信息。
备注:生工生物提供200多种通用引物,详情请见常用载体测序引物清单
直接登录 DNA测序网购系统,自动获取报价和下单;
TA克隆测序
TA Clone Sequencing
TA克隆技术(TA cloning)把PCR片段与一个具有3’ -T突出的载体DNA连接起来的方法。该方法利用Taq聚合酶有末端转移酶活性, 可在PCR产物的3’ 端加上一个非模板依赖碱基“A”。pUCm-T是一种高效克隆PCR产物的专用载体。因其3’ 端带有一个突出的“T”尾,能高效地与带“A”尾的PCR产物连接,极大地提高了克隆的效率。TA克隆是目前克隆PCR产物较简便、快捷的方法。
TA克隆测序即是将要测序的片段插入到克隆载体中,筛选出含有目的片段的质粒,然后提取质粒并对该质粒进行测序。除了可以测出目的片段之外,还可以根据需要提供拼接序列及高质量的质粒。
项目名称 | 样本类型 | 技术/设备平台 | 交付周期(工作日) | 交付结果 |
PCR产物TA克隆测序 | PCR产物(已纯化/未纯化) | 3730 XL测序仪 | 5~7 | ab1 格式的峰型彩图 seq 格式的序列文件可以提供高可选择返还高质量质粒 |
PCR产物
未纯化产物,样本量>=20 μl,浓度>=20 ng/μl;已纯化产物,样本量>=25 μl,浓度>=50 ng/μl;纯度:OD260/280 1.8~2.0; 送样前建议取3 μl样品电泳,能清晰检出单一明亮目的条带;请在订单上备注PCR所用引物的序列,以便用于克隆结果的核对分析;请提供克隆片段的相关信息,包括名称、大小、样品是否带有“A”尾以及PCR产物类型。 4°C冷藏运输。
下载 TA克隆测序订购表,填写后发送至shseq@sangon.com,由订单中心技术人员处理您的询价。
订单中心电话:021-57072160 / 61 / 62
Cosmid/Fosmid/BAC末端测序
Cosmid/Fosmid/BAC Terminal Sequencing
Cosmid 是Cos Site-Carrying Plasmid的缩写, 也称粘粒、柯斯载体。这是一类用于克隆大片段DNA的载体,它是由λ噬菌体的Cos(Cohesive) 末端及质粒(Plasmid)重组而成的载体。Cosmid的构建一般是利用质粒的复制子、选择标记,加上λ的Cos位点序列和包装有关的序列,构建的Cosmid可以很好地用于基因克隆。
Fosmid是由大肠杆菌F因子改造而成的克隆载体,可装载大片段外源DNA。
细菌人工染色体(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)文库的构建是进行基因组研究的一项重要基础性工作,特别是对大基因组及超大基因组生物来说更是如此,在物理作图、基因图位克隆、基因结构和调控等研究中发挥了重要作用。
末端测序技术通过测定插入片段两端的序列,能够迅速而精确地进行序列拼装,并确定基因组序列结构的多态性,如倒置和易位等,在基因组全序列测序中有着举足轻重的作用。
项目名称 | 样本类型 | 技术/设备平台 | 交付周期(工作日) | 交付结果 |
BAC测序 | BAC质粒、菌样 | 3730 XL测序仪 | 3~5 | ab1格式的峰型彩图 seq格式的序列文件 |
Cosmid 测序 | Cosmid质粒、菌样 | |||
Fosmid 测序 | Fosmid质粒、菌样 |
质粒
样品量>=20 μl,浓度>=100 ng/μl,总量>=1 μg,纯度 OD260/280 1.8~2.0;
有条件情况下建议提供200 μl含有相应质粒的菌液备用;需注明载体全称、插入目的片段长度、测序要求
液体质粒:4°C 冷藏运输,干粉质粒:常温运输
菌样
样本量>=200 μl(菌液);
建议为过夜培养(12h)的新鲜菌液,尽量为高拷贝质粒,如为低拷贝质粒,建议直接提供质粒;需注明培养基、载体名称、是否需要诱导及抗性类型(除氨苄和卡那抗性,其余需自备);
4°冷藏运输;
菌液请放入EP管中,用封口膜封口,避免交叉污染;平板菌落请圈选标记,加缓冲垫以防运输中破损;
订购需先拨打订单中心电话,跟技术人员沟通后,会由技术人员发给您相应的订购表,填写后发送至shseq@sangon.com,由订单中心技术人员处理您的询价。
订单中心电话:021-57072160 / 61 / 62
上海总部测序部
电话:021-57072160 / 61 / 62
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