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small RNA测序
项目简介

Small RNA是一类重要的体内调节分子,长度在18-30 nt之间,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量,从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。

技术支持

Tel: 021-57072097
021-57072177

E-mail: rnaseq@sangon.com
rnaseq2@sangon.com

测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据质控后,进行Clean reads 长度分布统计,small RNA注释,已知 miRNA 注释,已知piRNA注释,ncRNA分析,新 miRNA 预测(有参考基因组),差异基因可视化分析,miRNA 家族分析,差异表达 miRNA 聚类分析,miRNA靶基因预测,靶基因GO、KEGG富集分析。

  1. 分析项目
  2. 样本要求
  3. 常见问题
  4. 案例展示
实验流程
订购信息
客户提供
提供样品

组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。 具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的《RNA类高通量测序样品要求》。

提供信息

告知物种信息以及对照与实验样品(如有分组,详细描述分组分析信息)

交付

  1. 测序原始数据
  2. 实验结果类文件
  3. 分析报告以及分析结果文件
  4. 部分发表文章用的方法描述