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真核/原核有参mRNA-Seq
项目介绍

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,狭义上指所有mRNA的集合。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。

技术支持

电    话:021-57072097
021-57072177

E-mail: rnaseq@sangon.com
rnaseq2@sangon.com

测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。

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组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。 具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的《RNA类高通量测序样品要求》。

提供信息

告知物种信息以及对照与实验样品(如有分组,详细描述分组分析信息)

交付
  1. 测序原始数据
  2. 实验结果类文件
  3. 分析报告以及分析结果文件
  4. 部分发表文章用的方法描述