宏基因组测序
【最新活动】新版《宏基因组微生物分类测序手册》下载
服务简介
宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的前沿领域。对环境样本进行DNA提取后进行区域选择性扩增(如细菌16S V1-V9相应区域),再对扩增产物进行建库、测序,然后对所得的数据进行生物信息学分析。生物信息分析主要包括OTU的生成、取样充足性分析、丰度和多样性分析、菌群间差异分析、假设验证分析、进化树分析等。
主要流程
Miseq平台宏基因组测序
ION TORRENT宏基因组测序
订购信息
项目名称 | 内容 | 周期 | 价格 |
基因组DNA提取 | 宏基因组类样品基因组提取 | 1~5日 | 询价 |
16s-18s-ITS扩增服务 | 3~10日 | ||
高通量测序服务 | Miseq 2X300或ION TORRENT平台,平均大于4万条序列/样品 | 3~5日 | |
数据分析服务 | 10日 |
客户提供
提供样品
总DNA或者包装完好的原始样品(如土壤、粪便、水体和口腔物);样品名称清晰,冷藏运输。具体要求参看后附《高通量测序样品要求》。
提供信息
如有对照与实验样品的区分,讲明正常样品与实验样品,如有分组,详细描述分组分析信息,以及分组比较的分析需求信息。
交付
交付报告
测序原始数据
实验结果类文件
分析析报告以及分析结果文件。
部分发表文章用的方法描述性书写(定制性)。