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质粒抽提常见问题解答
1.没有DNA被洗脱出来
没有用乙醇稀释Wash Buffer,按前面指导的方法准备DNA Wash Buffer
2.DNA产量低
a.细胞裂解率低
只使用含有氨苄青霉素的LB或YT培养基.使用基本方案时,不要使用超过5ml的高拷贝质粒培养物.
在加入Solution‖前细胞没有充分混匀,可漩渦振荡悬浮液使之充分混匀.加入Solution‖后,延长孵育时间可获得清晰的裂解液.如果Solution‖没有盖紧,可能需要重配.可按以下准备:0.2N NaOH,1%SDS.
b.细菌培养物生长过度或不新鲜
不要于37℃培养超过16小时,分离质粒前长时间存放培养物是不利的.
c.使用的是低拷贝数质粒
增加培养物的体积至10ml,或使用质粒小量提取试剂盒II,培养物体积为25ml.
3.产量中有大分子量的DNA污染
加入Solution‖后过分混和细胞裂解液,加入Solution‖后不要猛烈振荡或搖匀,可轻轻颠倒离心管几次使充分混匀
4.光密度与琼脂糖凝胶上的DNA不符
从柱子洗脱下來的痕量杂质使A260升高;确保按操作指南中的步骤7和8洗脱柱子;另外,还依赖于琼脂糖/溴化乙锭电泳测定
5. 琼脂糖凝胶上可见RNA帶
SolutionI没有加入RNase A
6. 在琼脂糖凝胶上点样时,质粒漂出点样孔
洗脱步骤后,乙醇没有完全从柱子上去除;按标准操作步骤中完全甩干spin-column。 |